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  • Parcours Bio-informatique et Intelligence Artificielle (BIX)

    Au cours des vingt der­nières années, la bio-infor­ma­tique s’est impo­sée comme un domaine cen­tral des sciences du vivant, à l’interface de la bio­lo­gie, de la géné­tique, de l’informatique et de la science des don­nées. Le séquen­çage à haut débit pro­duit désor­mais des don­nées bio­lo­giques à une échelle sans pré­cé­dent, dont l’analyse repose de plus en plus sur des approches com­pu­ta­tion­nelles avan­cées et sur l’intelligence arti­fi­cielle. Le par­cours BIX forme des spé­cia­listes de la bio-infor­ma­tique dotés d’une solide exper­tise en infor­ma­tique et en intel­li­gence arti­fi­cielle, capables de trans­for­mer des don­nées géno­miques et molé­cu­laires mas­sives en connais­sances exploi­tables pour la méde­cine de pré­ci­sion, l’agriculture durable, la sécu­ri­té ali­men­taire et les biotechnologies.

    Contexte pédagogique

    • La géno­mique et la géné­tique sont au cœur scien­ti­fique du parcours.
    • L’intelligence arti­fi­cielle, le cal­cul haute per­for­mance, la modé­li­sa­tion sta­tis­tique et le génie logi­ciel en consti­tuent le cadre méthodologique.
    • Les génomes, les réseaux de régu­la­tion, les voies molé­cu­laires et les popu­la­tions sont abor­dés comme des sys­tèmes com­plexes, de grande dimen­sion et multi-échelles.
    • Le par­cours s’adresse aux diplô­més en sciences du vivant comme aux diplô­més en infor­ma­tique, science des don­nées, mathé­ma­tiques ou ingénierie.
    • Les étu­diants apprennent à conce­voir les méthodes, et non seule­ment à uti­li­ser des outils exis­tants. Ils pro­gramment en Python, R et Java et tra­vaillent sous Linux et sur infra­struc­tures HPC.
    • Les étu­diants ana­lysent des don­nées réelles de séquen­çage en lec­tures courtes et longues, du contrôle qua­li­té jusqu’à l’assemblage de novo de génomes.
    • L’enseignement est dis­pen­sé en anglais, avec des inter­ven­tions de cher­cheurs d’institutions de pre­mier plan en Europe et aux États-Unis.

    Objectifs professionnels

    Les diplô­més exercent comme ingé­nieurs et cher­cheurs en bio-infor­ma­tique, en labo­ra­toire de recherche, en équipe R&D ou en entre­prise. Leurs sec­teurs couvrent la géno­mique et la géné­tique, la méde­cine de pré­ci­sion et la science des don­nées de san­té, l’agroa­li­men­taire et la géno­mique végé­tale, la qua­li­té et la sécu­ri­té des ali­ments, ain­si que les bio­tech­no­lo­gies et la R&D phar­ma­ceu­tique.

    Ils peuvent aus­si pour­suivre en doc­to­rat en bio-infor­ma­tique ou en bio­lo­gie com­pu­ta­tion­nelle. Ils savent ana­ly­ser de manière auto­nome des don­nées géno­miques à haut débit, appli­quer l’apprentissage auto­ma­tique aux don­nées bio­lo­giques et conce­voir des logi­ciels bio-infor­ma­tiques robustes.

    Contact et documentation

    Res­pon­sable mas­ter
    San­drine Moran­dat
     +33 (0)3 44 23 44 23
    Res­pon­sable du par­cours
    Fady Moha­reb
     +33 (0)3 44 23 43 53
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